Després d'un camí excavat en la roca s'arriba a l'entrada de la cova en una cota de 12/14 metres sobre el nivell del mar, des d'on s'inicia la visita. La cova té una antiguitat de més de 100.000 anys i es va formar per falles tel•lúriques. Ha passat per glaciacions i calors tropicals, estant en l'actualitat gairebé fossilitzada, excepte en les més profundes galeries, on el degoteig continua formant belles estalactites i estalagmites.

La cavitat denominada Can Marçà va ser descoberta i utilitzada per contrabandistes, qui amagaven en aquesta embalums de mercaderies hissant-les des del mar des d'una obertura situada en una cota de/8 10 metres. Actualment es poden distingir clarament els senyals de pintura, vermella o negra, que marcaven el camí cap a altra sortida en cas de fugida o emergència.

En les formes geològiques queden paleses la riquesa del curs d'aigües subterrànies que discorrien, quedant fossilitzades les cascades i cursos de les aigües.

Els materials que s'aprecien en l'interior de la cova, són bàsicament carbonat càlcic, òxid de ferro, magnesi, argila, etc.

Les aportacions dels geòlegs i espeleòlegs que han intervingut per a la posada a punt de la cova han consistit a reproduir el que va existir en temps remots, recuperant les cascades i els cursos que van existir en aquells temps.

S'han trobat ossos i fòssils d'animals rosegadors d'espècies extingides, els esquelets de les quals van ser traslladats al Museu d'Història Natural per a la seva corresponent catalogació i per a enriquir la fauna prehistòrica de les nostres velles terres mediterrànies.